Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHC1Q5JVL4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms