Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRK1Q15835 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRK1Q15835 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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