Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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