Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPQ12770 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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