Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCA6Q12454 HEM3YDL205C 984 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 ERP5YHR110W 639 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 MRP17YKL003C 396 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 MRPL22YNL177C 930 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 SHM1YBR263W 1473 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 HIS7YBR248C 1659 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 YEL077CYEL077C 3834 nt5.74□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 YKL031WYKL031W 414 nt5.73□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 HOR7YMR251W-A 180 nt5.73□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 CDC19YAL038W 1503 nt5.73□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 GPA1YHR005C 1419 nt5.73□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 UBP13YBL067C 2244 nt5.72□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 PDH1YPR002W 1551 nt5.72□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 YGR022CYGR022C 330 nt5.72□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 DPH5YLR172C 903 nt5.72□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 ARR3YPR201W 1215 nt5.72□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 MKK1YOR231W 1527 nt5.72□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 VNX1YNL321W 2727 nt5.72□□□□□ -1.49
OCA6Q12454 RNR3YIL066C 2610 nt5.71□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 YDR154CYDR154C 351 nt5.71□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 RPR2YIR015W 435 nt5.71□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 PRS1YKL181W 1284 nt5.71□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 RRN3YKL125W 1884 nt5.71□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 ALT1YLR089C 1779 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 DON1YDR273W 1098 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 DCN1YLR128W 810 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 MLC2YPR188C 492 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 HXT15YDL245C 1704 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 HXT16YJR158W 1704 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 NRD1YNL251C 1728 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 SUB2YDL084W 1341 nt5.7□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 HAL5YJL165C 2568 nt5.69□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 SEC12YNR026C 1416 nt5.69□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 TRP1YDR007W 675 nt5.69□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 YIL060WYIL060W 435 nt5.69□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 MTC2YKL098W 1074 nt5.69□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 IME2YJL106W 1938 nt5.68□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 CBP4YGR174C 513 nt5.68□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 TEL2YGR099W 2067 nt5.67□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 RPT4YOR259C 1314 nt5.67□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 CWC27YPL064C 906 nt5.66□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 DBF4YDR052C 2115 nt5.65□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 SSY5YJL156C 2100 nt5.65□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 ADY2YCR010C 852 nt5.65□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 PGA2YNL149C 390 nt5.65□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.65□□□□□ -1.5
OCA6Q12454 BUL1YMR275C 2931 nt5.65□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 FRE3YOR381W 2136 nt5.65□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 EFM4YIL064W 774 nt5.64□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 MRPL36YBR122C 534 nt5.64□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 SSZ1YHR064C 1617 nt5.63□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 HCR1YLR192C 798 nt5.63□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 RHB1YCR027C 630 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 HGH1YGR187C 1185 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 YHC3YJL059W 1227 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 HXT3YDR345C 1704 nt5.62□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 YDL034WYDL034W 345 nt5.61□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 BUD9YGR041W 1644 nt5.61□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.61□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 ARG1YOL058W 1263 nt5.61□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 ODC2YOR222W 924 nt5.61□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 COX11YPL132W 903 nt5.61□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 STL1YDR536W 1710 nt5.6□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 SHE10YGL228W 1734 nt5.6□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 SIP5YMR140W 1470 nt5.6□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 HFI1YPL254W 1467 nt5.6□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 RSC30YHR056C 2652 nt5.6□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 YDL121CYDL121C 450 nt5.59□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 COX26YDR119W-A 201 nt5.59□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 NQM1YGR043C 1002 nt5.59□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 YLR194CYLR194C 765 nt5.59□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 PGA3YML125C 939 nt5.59□□□□□ -1.51
OCA6Q12454 RAT1YOR048C 3021 nt5.58□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.58□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 COS9YKL219W 1224 nt5.58□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 YBL044WYBL044W 369 nt5.58□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 RPS15YOL040C 429 nt5.58□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 TRK2YKR050W 2670 nt5.58□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 PCS60YBR222C 1632 nt5.57□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 GLO2YDR272W 825 nt5.57□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.57□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 PIN2YOR104W 849 nt5.57□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 FLC3YGL139W 2409 nt5.57□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 OCA5YHL029C 2040 nt5.57□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 VHS1YDR247W 1386 nt5.56□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 TAX4YJL083W 1815 nt5.56□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 CAD1YDR423C 1230 nt5.56□□□□□ -1.52
OCA6Q12454 YKR041WYKR041W 753 nt5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms