Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.53□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 ACF2YLR144C 2340 nt4.53□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 STE13YOR219C 2796 nt4.53□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 SCT1YBL011W 2280 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 HFI1YPL254W 1467 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 IRC7YFR055W 1023 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 RRP46YGR095C 672 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 HCR1YLR192C 798 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 MTQ1YNL063W 945 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 ORC5YNL261W 1440 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 TRP5YGL026C 2124 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 PDH1YPR002W 1551 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YFL052WYFL052W 1398 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 SPS22YCL048W 1392 nt4.52□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 QNS1YHR074W 2145 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 HEM3YDL205C 984 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YDR053WYDR053W 396 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 CDC11YJR076C 1248 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 MRP51YPL118W 1035 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 GPT2YKR067W 2232 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 PUF3YLL013C 2640 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 GAA1YLR088W 1845 nt4.51□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YFL034WYFL034W 3222 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 HXT3YDR345C 1704 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 GDA1YEL042W 1557 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YCL065WYCL065W 369 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YRA1YDR381W 681 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 ERP5YHR110W 639 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YKL031WYKL031W 414 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YBL044WYBL044W 369 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 IDP3YNL009W 1263 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 PGA2YNL149C 390 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 RPS15YOL040C 429 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 RDL2YOR286W 450 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 TKL1YPR074C 2043 nt4.5□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 PDC1YLR044C 1692 nt4.49□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 GEP5YLR091W 882 nt4.49□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 RPT4YOR259C 1314 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 JIP4YDR475C 2631 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 ABZ1YNR033W 2364 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 VTC2YFL004W 2487 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 UGO1YDR470C 1509 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 MDH3YDL078C 1032 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 YDL172CYDL172C 480 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 SYF2YGR129W 648 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 SNO4YMR322C 714 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 HSP33YOR391C 714 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 HSP32YPL280W 714 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 CMR1YDL156W 1569 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 UTP7YER082C 1665 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 TRK2YKR050W 2670 nt4.48□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 MTF2YDL044C 1323 nt4.47□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 UTP18YJL069C 1785 nt4.47□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 TEL2YGR099W 2067 nt4.47□□□□□ -1.69
YHP1Q04116 DBP9YLR276C 1785 nt4.46□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 GLO2YDR272W 825 nt4.46□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SOH1YGL127C 384 nt4.46□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 HPF1YOL155C 2904 nt4.46□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 GUF1YLR289W 1938 nt4.46□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 TEF1YPR080W 1377 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 TEF2YBR118W 1377 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YDL144CYDL144C 1071 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CDC43YGL155W 1131 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CBP4YGR174C 513 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 ERI1YPL096C-A 207 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 EMW1YNL313C 2715 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 ASN1YPR145W 1719 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SIA1YOR137C 1869 nt4.45□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SHE10YGL228W 1734 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 RGT1YKL038W 3513 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CHL4YDR254W 1377 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YDL119CYDL119C 924 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 MTQ2YDR140W 666 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 PAN6YIL145C 930 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 MND2YIR025W 1107 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CSL4YNL232W 879 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CHS5YLR330W 2016 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CDC16YKL022C 2523 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 UBA1YKL210W 3075 nt4.44□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SHM1YBR263W 1473 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 MNN2YBR015C 1794 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YDR154CYDR154C 351 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YDR541CYDR541C 1035 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 MTC2YKL098W 1074 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 PGA3YML125C 939 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YNR048WYNR048W 1182 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 FAT3YKL187C 2253 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 BUD9YGR041W 1644 nt4.43□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 PAP2YOL115W 1755 nt4.42□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CDC19YAL038W 1503 nt4.42□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 RHO4YKR055W 876 nt4.42□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SMF3YLR034C 1422 nt4.42□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 MRPL22YNL177C 930 nt4.42□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YAP1801YHR161C 1914 nt4.42□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 RPT2YDL007W 1314 nt4.42□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CRZ1YNL027W 2037 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 RSC30YHR056C 2652 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 ASF2YDL197C 1578 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YIR007WYIR007W 2295 nt4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.3 ms