Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO1P63165 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms