Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TMEM258P61165 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TMEM258P61165 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms