Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOSBP53539 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOSBP53539 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOSBP53539 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
FOSBP53539 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOSBP53539 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOSBP53539 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOSBP53539 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOSBP53539 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOSBP53539 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOSBP53539 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOSBP53539 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOSBP53539 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOSBP53539 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOSBP53539 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOSBP53539 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOSBP53539 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOSBP53539 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOSBP53539 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOSBP53539 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOSBP53539 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOSBP53539 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOSBP53539 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOSBP53539 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOSBP53539 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOSBP53539 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOSBP53539 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOSBP53539 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOSBP53539 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOSBP53539 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOSBP53539 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOSBP53539 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOSBP53539 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOSBP53539 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FOSBP53539 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FOSBP53539 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOSBP53539 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOSBP53539 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOSBP53539 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOSBP53539 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOSBP53539 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOSBP53539 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOSBP53539 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOSBP53539 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOSBP53539 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOSBP53539 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOSBP53539 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOSBP53539 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOSBP53539 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOSBP53539 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOSBP53539 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOSBP53539 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOSBP53539 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOSBP53539 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOSBP53539 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOSBP53539 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOSBP53539 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms