Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.751e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.741e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.641e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.611e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 HGS-208ENST00000572392 824 ntTSL 524.59■■□□□ 1.531e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-205ENST00000376456 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.76■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-210ENST00000438429 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.78□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TBC1D5-228ENST00000486224 526 ntTSL 39.56□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 KIAA1217-216ENST00000635504 568 ntTSL 47.07□□□□□ -1.281e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 45.54□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 GALK2-212ENST00000559454 1768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.027e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 GALK2-217ENST00000560119 2053 ntTSL 214.14□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.51■■■■□ 3.925e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-221ENST00000587568 607 ntTSL 524.59■■□□□ 1.535e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.665e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-204ENST00000431259 1472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-231ENST00000589434 1066 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.45e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-270ENST00000630096 915 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.45e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-236ENST00000590040 855 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.385e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-207ENST00000442329 832 ntTSL 214.49□□□□□ -0.095e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-239ENST00000590807 728 ntTSL 514.49□□□□□ -0.095e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-218ENST00000586452 828 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.095e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-256ENST00000620591 797 ntTSL 513.69□□□□□ -0.225e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-220ENST00000586831 718 ntTSL 513.21□□□□□ -0.295e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-249ENST00000592750 619 ntTSL 512.21□□□□□ -0.455e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-229ENST00000589355 498 ntTSL 312.08□□□□□ -0.485e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-223ENST00000587944 991 ntTSL 512.01□□□□□ -0.495e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.555e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-248ENST00000592689 767 ntTSL 511.42□□□□□ -0.585e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-257ENST00000625480 633 ntTSL 511.36□□□□□ -0.595e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-262ENST00000626954 864 ntTSL 511.36□□□□□ -0.595e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-260ENST00000626138 693 ntTSL 511.36□□□□□ -0.595e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-251ENST00000604571 587 ntTSL 511.33□□□□□ -0.65e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-214ENST00000585358 760 ntTSL 511.16□□□□□ -0.625e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-234ENST00000589842 635 ntTSL 511.16□□□□□ -0.625e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-242ENST00000591466 761 ntTSL 511.14□□□□□ -0.635e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-227ENST00000588804 1118 ntTSL 511.07□□□□□ -0.645e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.695e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-259ENST00000626117 572 ntTSL 59.45□□□□□ -0.95e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-247ENST00000592630 666 ntTSL 59.35□□□□□ -0.915e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-246ENST00000592600 762 ntTSL 59.32□□□□□ -0.925e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-216ENST00000585487 755 ntTSL 38.74□□□□□ -1.015e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.015e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-241ENST00000591332 528 ntTSL 58.74□□□□□ -1.015e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-266ENST00000628296 483 ntTSL 58.7□□□□□ -1.025e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-230ENST00000589391 811 ntTSL 58.59□□□□□ -1.035e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.085e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-224ENST00000588244 743 ntTSL 57.6□□□□□ -1.195e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-255ENST00000614124 463 ntTSL 56.84□□□□□ -1.315e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.325e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.445e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-225ENST00000588257 814 ntTSL 56.03□□□□□ -1.445e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-250ENST00000592836 595 ntTSL 55.85□□□□□ -1.475e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.515e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.525e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TTN-AS1-208ENST00000450692 723 ntTSL 55.01□□□□□ -1.615e-10■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 ARHGEF7-210ENST00000449979 682 ntTSL 527.14■■□□□ 1.944e-9■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 ARHGEF7-212ENST00000467053 691 ntTSL 323.45■■□□□ 1.344e-9■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 ARHGEF7-211ENST00000466143 1681 ntTSL 520.51■□□□□ 0.874e-9■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 ARHGEF7-218ENST00000491775 581 ntTSL 418.59■□□□□ 0.574e-9■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 ARHGEF7-213ENST00000469877 1501 ntTSL 218■□□□□ 0.474e-9■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.519e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 RPL13A-208ENST00000477613 796 ntTSL 527.67■■■□□ 2.023e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 RPL13A-209ENST00000479992 850 ntTSL 324.94■■□□□ 1.583e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 RPL13A-211ENST00000486930 652 ntTSL 324.9■■□□□ 1.583e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 RPL13A-202ENST00000467825 660 ntTSL 524.05■■□□□ 1.443e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 RPL13A-204ENST00000472481 728 ntTSL 223.78■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 RPL13A-210ENST00000484279 794 ntTSL 521.84■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.013e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TOP2B-203ENST00000424225 3525 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 ALDH1A2-224ENST00000561070 554 ntTSL 415.59■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 ALDH1A2-215ENST00000559266 545 ntTSL 415.42■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 212.47□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 218.56■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 36.58□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 PPFIA1-225ENST00000638133 814 ntTSL 323.48■■□□□ 1.354e-11■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 PPFIA1-219ENST00000531657 3036 ntTSL 213.49□□□□□ -0.254e-11■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 PPFIA1-204ENST00000525922 358 ntTSL 312.37□□□□□ -0.434e-11■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)12.21□□□□□ -0.454e-11■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 PPFIA1-215ENST00000530548 3774 ntTSL 210.97□□□□□ -0.654e-11■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.666e-9■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.626e-9■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.146e-9■■■■■ 33.2
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 685 ms