Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAMP7P51809 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP7P51809 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms