Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMAN1P49257 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms