Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF5P43026 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF5P43026 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF5P43026 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF5P43026 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF5P43026 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF5P43026 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF5P43026 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF5P43026 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF5P43026 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF5P43026 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF5P43026 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF5P43026 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF5P43026 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF5P43026 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF5P43026 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF5P43026 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF5P43026 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF5P43026 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF5P43026 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF5P43026 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF5P43026 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF5P43026 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF5P43026 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF5P43026 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF5P43026 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF5P43026 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF5P43026 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF5P43026 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF5P43026 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF5P43026 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF5P43026 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF5P43026 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF5P43026 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF5P43026 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF5P43026 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF5P43026 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF5P43026 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF5P43026 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF5P43026 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF5P43026 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF5P43026 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF5P43026 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF5P43026 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF5P43026 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF5P43026 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF5P43026 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF5P43026 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF5P43026 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF5P43026 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF5P43026 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF5P43026 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF5P43026 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms