Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 LSG1YGL099W 1923 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT7P35177 BZZ1YHR114W 1902 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT7P35177 ASH1YKL185W 1767 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT7P35177 TBF1YPL128C 1689 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT7P35177 MLC1YGL106W 450 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT7P35177 YPL041CYPL041C 624 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT7P35177 YME1YPR024W 2244 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT7P35177 PIF1YML061C 2580 nt7.46□□□□□ -1.21
SPT7P35177 YEA6YEL006W 1008 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT7P35177 SIP2YGL208W 1248 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT7P35177 STL1YDR536W 1710 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT7P35177 GFA1YKL104C 2154 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT7P35177 BUL1YMR275C 2931 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT7P35177 TEA1YOR337W 2280 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 QNS1YHR074W 2145 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 GEX1YCL073C 1848 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 GEX2YKR106W 1848 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 SNZ3YFL059W 897 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 SNZ2YNL333W 897 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 PSH1YOL054W 1221 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 YPR098CYPR098C 486 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 SAC6YDR129C 1929 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 MCM6YGL201C 3054 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 CIT3YPR001W 1461 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT7P35177 RHO2YNL090W 579 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT7P35177 ATP4YPL078C 735 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT7P35177 YBR124WYBR124W 360 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT7P35177 GPT2YKR067W 2232 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT7P35177 KNH1YDL049C 807 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT7P35177 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT7P35177 YNR042WYNR042W 429 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT7P35177 PDH1YPR002W 1551 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT7P35177 SEC12YNR026C 1416 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT7P35177 YKL223WYKL223W 333 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT7P35177 IDP3YNL009W 1263 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT7P35177 SHO1YER118C 1104 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT7P35177 YMR010WYMR010W 1218 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT7P35177 POR1YNL055C 852 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT7P35177 RIM101YHL027W 1878 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT7P35177 RFA1YAR007C 1866 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YRA1YDR381W 681 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT7P35177 RPS15YOL040C 429 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT7P35177 BAP2YBR068C 1830 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YCL065WYCL065W 369 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT7P35177 MTQ1YNL063W 945 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT7P35177 HXT3YDR345C 1704 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT7P35177 ACF2YLR144C 2340 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YJR015WYJR015W 1533 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT7P35177 SOG2YOR353C 2376 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YBR226CYBR226C 411 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT7P35177 SHM1YBR263W 1473 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YCL041CYCL041C 495 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT7P35177 RAT1YOR048C 3021 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT7P35177 TRP3YKL211C 1455 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT7P35177 HFI1YPL254W 1467 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT7P35177 CLP1YOR250C 1338 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT7P35177 GIR2YDR152W 798 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT7P35177 YBL044WYBL044W 369 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT7P35177 PAN6YIL145C 930 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT7P35177 MRPL13YKR006C 795 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT7P35177 DCN1YLR128W 810 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT7P35177 VCX1YDL128W 1236 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT7P35177 YLR283WYLR283W 945 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT7P35177 MKK2YPL140C 1521 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT7P35177 SHE10YGL228W 1734 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT7P35177 SCT1YBL011W 2280 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT7P35177 YDR053WYDR053W 396 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT7P35177 PRM10YJL108C 1152 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT7P35177 HSP150YJL159W 1242 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT7P35177 HCR1YLR192C 798 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT7P35177 MRPL36YBR122C 534 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT7P35177 YIL060WYIL060W 435 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT7P35177 YKL031WYKL031W 414 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT7P35177 HXT17YNR072W 1695 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT7P35177 PGA2YNL149C 390 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT7P35177 MPA43YNL249C 1629 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT7P35177 GAA1YLR088W 1845 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT7P35177 STE13YOR219C 2796 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT7P35177 TRK2YKR050W 2670 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT7P35177 PDC1YLR044C 1692 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT7P35177 HPF1YOL155C 2904 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 HEM3YDL205C 984 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 MND2YIR025W 1107 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 LST8YNL006W 912 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 TEL2YGR099W 2067 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 UGO1YDR470C 1509 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 UTP7YER082C 1665 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 NUD1YOR373W 2556 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 FZF1YGL254W 900 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT7P35177 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.7 ms