Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	HAP2	YGL237C	798 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	LYS12	YIL094C	1116 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	SYN8	YAL014C	768 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	ARG1	YOL058W	1263 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	YOL163W	YOL163W	510 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	RPN7	YPR108W	1290 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	SHM1	YBR263W	1473 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	RAD3	YER171W	2337 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	MNN5	YJL186W	1761 nt		4.65	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	YFL042C	YFL042C	2025 nt		4.65	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	ORC5	YNL261W	1440 nt		4.65	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	ELP3	YPL086C	1674 nt		4.65	□□□□□ -1.66
VMA11	P32842	SOH1	YGL127C	384 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YIR020W-A	YIR020W-A	243 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	DAL3	YIR032C	588 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	APS3	YJL024C	585 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YML083C	YML083C	1257 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	TAX4	YJL083W	1815 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	TNA1	YGR260W	1605 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YJU3	YKL094W	942 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	SFB3	YHR098C	2790 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	RSC2	YLR357W	2670 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YHL017W	YHL017W	1599 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	RME1	YGR044C	903 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	GON7	YJL184W	372 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	RMA1	YKL132C	1293 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	ICT1	YLR099C	1185 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	PFK2	YMR205C	2880 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	PRP46	YPL151C	1356 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	TAH18	YPR048W	1872 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YML082W	YML082W	1950 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YPK2	YMR104C	2034 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	ARP2	YDL029W	1176 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	GIR2	YDR152W	798 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	ATO3	YDR384C	828 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	COG1	YGL223C	1254 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	MRS1	YIR021W	1092 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YPR123C	YPR123C	435 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	OPT1	YJL212C	2400 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	EIS1	YMR031C	2532 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	SEC20	YDR498C	1152 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YGL072C	YGL072C	360 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YLR194C	YLR194C	765 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	ARA2	YMR041C	1008 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YNL108C	YNL108C	813 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	DAL82	YNL314W	768 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	CSG2	YBR036C	1233 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	snR32	snR32	188 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	UBA1	YKL210W	3075 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YER010C	YER010C	705 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	MLC1	YGL106W	450 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YGR176W	YGR176W	348 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	STM1	YLR150W	822 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	PRP24	YMR268C	1335 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	DIA3	YDL024C	1407 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YMR027W	YMR027W	1413 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YDR396W	YDR396W	501 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YFL064C	YFL064C	525 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	RPS2	YGL123W	765 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	KSS1	YGR040W	1107 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	PHO86	YJL117W	936 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YME1	YPR024W	2244 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YTH1	YPR107C	627 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	RPO26	YPR187W	468 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YPR202W	YPR202W	717 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VMA11	P32842	YER186C	YER186C	921 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YJL193W	YJL193W	1209 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	PGU1	YJR153W	1086 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YKL223W	YKL223W	333 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	CAR1	YPL111W	1002 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YAP1801	YHR161C	1914 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	ERC1	YHR032W	1746 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	HSX1	tR(CCU)J	72 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	SCO2	YBR024W	906 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	MLC2	YPR188C	492 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	TEA1	YOR337W	2280 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	VMS1	YDR049W	1899 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	RTT106	YNL206C	1368 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	KNH1	YDL049C	807 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	COX26	YDR119W-A	201 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YER148W-A	YER148W-A	579 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	VMA16	YHR026W	642 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	RHO3	YIL118W	696 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	EFM3	YJR129C	1020 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	MRPL13	YKR006C	795 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	TFS1	YLR178C	660 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	PIN2	YOR104W	849 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	HSP78	YDR258C	2436 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	KEX2	YNL238W	2445 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	PKC1	YBL105C	3456 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	ACS2	YLR153C	2052 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	NCS6	YGL211W	1080 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	GAT4	YIR013C	366 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YLR118C	YLR118C	684 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	TAL1	YLR354C	1008 nt		4.55	□□□□□ -1.68

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