Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA11P31270 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA11P31270 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms