Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-FP30511 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms