Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND2P30279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND2P30279 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND2P30279 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCND2P30279 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND2P30279 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND2P30279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND2P30279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND2P30279 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND2P30279 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND2P30279 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND2P30279 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND2P30279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCND2P30279 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND2P30279 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND2P30279 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND2P30279 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND2P30279 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND2P30279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND2P30279 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND2P30279 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND2P30279 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND2P30279 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND2P30279 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND2P30279 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND2P30279 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND2P30279 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCND2P30279 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND2P30279 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND2P30279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND2P30279 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND2P30279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND2P30279 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND2P30279 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND2P30279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND2P30279 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND2P30279 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND2P30279 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND2P30279 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND2P30279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND2P30279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND2P30279 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND2P30279 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND2P30279 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND2P30279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND2P30279 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCND2P30279 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND2P30279 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND2P30279 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND2P30279 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND2P30279 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND2P30279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND2P30279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND2P30279 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms