Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRZ1P23471 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRZ1P23471 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRZ1P23471 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms