Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRP12270 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRP12270 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRP12270 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRP12270 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRP12270 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRP12270 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRP12270 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRP12270 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRP12270 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRP12270 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRP12270 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRP12270 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRP12270 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRP12270 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TPRP12270 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TPRP12270 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRP12270 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRP12270 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRP12270 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRP12270 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRP12270 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRP12270 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRP12270 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRP12270 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRP12270 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRP12270 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRP12270 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRP12270 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRP12270 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRP12270 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRP12270 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRP12270 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRP12270 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRP12270 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRP12270 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRP12270 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRP12270 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRP12270 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRP12270 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRP12270 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRP12270 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRP12270 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRP12270 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRP12270 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRP12270 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRP12270 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRP12270 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPRP12270 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPRP12270 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRP12270 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRP12270 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRP12270 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRP12270 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRP12270 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRP12270 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRP12270 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRP12270 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRP12270 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRP12270 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRP12270 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRP12270 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRP12270 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms