Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX5BP10606 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX5BP10606 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX5BP10606 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX5BP10606 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX5BP10606 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX5BP10606 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX5BP10606 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX5BP10606 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX5BP10606 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX5BP10606 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX5BP10606 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX5BP10606 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX5BP10606 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COX5BP10606 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX5BP10606 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX5BP10606 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX5BP10606 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX5BP10606 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX5BP10606 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX5BP10606 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX5BP10606 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms