Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV12-3P01733 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV12-3P01733 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV12-3P01733 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV12-3P01733 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms