Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR3O43761 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms