Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLOCKO15516 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLOCKO15516 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms