Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD9O15198 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD9O15198 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD9O15198 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms