Protein–RNA interactions for Protein: O14556

GAPDHS, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, testis-specific, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHSO14556 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAPDHSO14556 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GAPDHSO14556 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAPDHSO14556 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms