Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFI1A8K8P3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFI1A8K8P3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFI1A8K8P3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SFI1A8K8P3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SFI1A8K8P3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SFI1A8K8P3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFI1A8K8P3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFI1A8K8P3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms