Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRIQ3A6PVS8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms