Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC78A2IDD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms