Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH4Q9UIA0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms