Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms