Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms