Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms