Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LRP1BQ9NZR2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LRP1BQ9NZR2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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