Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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