Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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