Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms