Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRRC3Q9BY71 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms