Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms