Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms