Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LYSTQ99698 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LYSTQ99698 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms