Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms