Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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