Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PROX1Q92786 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PROX1Q92786 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PROX1Q92786 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PROX1Q92786 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PROX1Q92786 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms