Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms