Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms