Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms