Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms