Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGDCC3Q8IVU1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms