Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms